Вещи, документы, фотографии из семейных архивов в фонды Еврейского музея и центра толерантности начали поступать за полгода до официального открытия Еврейского музея и центра толерантности. На сегодняшний день, число их таково, что музей может представлять экспозиции, связанные с повседневной жизнью евреев в течение ХХ века в Российской Империи и СССР. Значительную коллекцию составляют материалы, связанные со Второй Мировой войной. Это документы, письма, фотографии, наградные листы и личные вещи, интервью и семейные истории евреев, которые побывали на войне. К 9 мая в зале Великой Отечественной войны впервые будут представлены новые экспонаты из музейного фонда: инструменты военврача, гвардейский значок восемнадцатилетней медсестры, поврежденный осколком мины, письмо генералу от матери и тд. Этот проект станет началом регулярного обновления и ротации экспонатов на основе уникального материала, собранного за эти годы.